Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV7

Extl1, Exostosin-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Extl1Q9JKV7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Extl1Q9JKV7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Extl1Q9JKV7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Extl1Q9JKV7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Extl1Q9JKV7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Extl1Q9JKV7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Extl1Q9JKV7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Extl1Q9JKV7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Extl1Q9JKV7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Extl1Q9JKV7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Extl1Q9JKV7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Extl1Q9JKV7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Extl1Q9JKV7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Extl1Q9JKV7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Extl1Q9JKV7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Extl1Q9JKV7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Extl1Q9JKV7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Extl1Q9JKV7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Extl1Q9JKV7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Extl1Q9JKV7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Extl1Q9JKV7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Extl1Q9JKV7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Extl1Q9JKV7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Extl1Q9JKV7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Extl1Q9JKV7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Extl1Q9JKV7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Extl1Q9JKV7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Extl1Q9JKV7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Extl1Q9JKV7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Extl1Q9JKV7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Extl1Q9JKV7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Extl1Q9JKV7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Extl1Q9JKV7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Extl1Q9JKV7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Extl1Q9JKV7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Extl1Q9JKV7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Extl1Q9JKV7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Extl1Q9JKV7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Extl1Q9JKV7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Extl1Q9JKV7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Extl1Q9JKV7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Extl1Q9JKV7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Extl1Q9JKV7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Extl1Q9JKV7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms