Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms