Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms