Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim23Q9DAL0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms