Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms