Protein–RNA interactions for Protein: Q9D742

Ap5s1, AP-5 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5s1Q9D742 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap5s1Q9D742 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap5s1Q9D742 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap5s1Q9D742 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap5s1Q9D742 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap5s1Q9D742 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap5s1Q9D742 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap5s1Q9D742 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap5s1Q9D742 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap5s1Q9D742 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap5s1Q9D742 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap5s1Q9D742 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap5s1Q9D742 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap5s1Q9D742 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap5s1Q9D742 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap5s1Q9D742 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap5s1Q9D742 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap5s1Q9D742 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap5s1Q9D742 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap5s1Q9D742 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap5s1Q9D742 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap5s1Q9D742 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap5s1Q9D742 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap5s1Q9D742 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap5s1Q9D742 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap5s1Q9D742 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap5s1Q9D742 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap5s1Q9D742 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap5s1Q9D742 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap5s1Q9D742 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap5s1Q9D742 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap5s1Q9D742 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap5s1Q9D742 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap5s1Q9D742 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap5s1Q9D742 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap5s1Q9D742 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap5s1Q9D742 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap5s1Q9D742 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap5s1Q9D742 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap5s1Q9D742 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap5s1Q9D742 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap5s1Q9D742 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap5s1Q9D742 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap5s1Q9D742 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 302.9 ms