Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Pramef12Q9D2F1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
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Pramef12Q9D2F1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Pramef12Q9D2F1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pramef12Q9D2F1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms