Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms