Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms