Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ciao1Q99KN2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms