Protein–RNA interactions for Protein: Q99J21

Mcoln1, Mucolipin-1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcoln1Q99J21 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mcoln1Q99J21 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mcoln1Q99J21 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mcoln1Q99J21 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Mcoln1Q99J21 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mcoln1Q99J21 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mcoln1Q99J21 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mcoln1Q99J21 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mcoln1Q99J21 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mcoln1Q99J21 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mcoln1Q99J21 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mcoln1Q99J21 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mcoln1Q99J21 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mcoln1Q99J21 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Mcoln1Q99J21 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mcoln1Q99J21 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mcoln1Q99J21 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mcoln1Q99J21 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mcoln1Q99J21 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mcoln1Q99J21 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mcoln1Q99J21 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mcoln1Q99J21 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mcoln1Q99J21 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mcoln1Q99J21 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mcoln1Q99J21 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mcoln1Q99J21 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mcoln1Q99J21 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mcoln1Q99J21 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mcoln1Q99J21 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mcoln1Q99J21 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mcoln1Q99J21 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mcoln1Q99J21 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mcoln1Q99J21 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mcoln1Q99J21 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mcoln1Q99J21 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Mcoln1Q99J21 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mcoln1Q99J21 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mcoln1Q99J21 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mcoln1Q99J21 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mcoln1Q99J21 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mcoln1Q99J21 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mcoln1Q99J21 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mcoln1Q99J21 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mcoln1Q99J21 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mcoln1Q99J21 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mcoln1Q99J21 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Mcoln1Q99J21 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Mcoln1Q99J21 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mcoln1Q99J21 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms