Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Prpf3Q922U1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms