Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
1700001C19RikQ8K168 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms