Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Lrrc9Q8CDN9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Lrrc9Q8CDN9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Lrrc9Q8CDN9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Lrrc9Q8CDN9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Lrrc9Q8CDN9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Lrrc9Q8CDN9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Lrrc9Q8CDN9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Lrrc9Q8CDN9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.53
Lrrc9Q8CDN9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Lrrc9Q8CDN9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Lrrc9Q8CDN9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Lrrc9Q8CDN9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Lrrc9Q8CDN9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Lrrc9Q8CDN9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Lrrc9Q8CDN9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Lrrc9Q8CDN9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Lrrc9Q8CDN9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Lrrc9Q8CDN9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Lrrc9Q8CDN9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Lrrc9Q8CDN9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Lrrc9Q8CDN9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Lrrc9Q8CDN9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Lrrc9Q8CDN9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Lrrc9Q8CDN9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Lrrc9Q8CDN9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Lrrc9Q8CDN9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Lrrc9Q8CDN9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Lrrc9Q8CDN9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Lrrc9Q8CDN9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Lrrc9Q8CDN9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Lrrc9Q8CDN9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Lrrc9Q8CDN9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Lrrc9Q8CDN9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Lrrc9Q8CDN9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Lrrc9Q8CDN9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Lrrc9Q8CDN9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Lrrc9Q8CDN9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Lrrc9Q8CDN9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Lrrc9Q8CDN9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Lrrc9Q8CDN9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Lrrc9Q8CDN9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Lrrc9Q8CDN9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Lrrc9Q8CDN9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Lrrc9Q8CDN9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Lrrc9Q8CDN9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Lrrc9Q8CDN9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Lrrc9Q8CDN9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Lrrc9Q8CDN9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Lrrc9Q8CDN9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Lrrc9Q8CDN9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Lrrc9Q8CDN9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Lrrc9Q8CDN9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Lrrc9Q8CDN9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Lrrc9Q8CDN9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Lrrc9Q8CDN9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms