Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8W7

A930004D18Rik, MCG147224, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A930004D18RikQ8C8W7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms