Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfibp1Q8C8U0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfibp1Q8C8U0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfibp1Q8C8U0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfibp1Q8C8U0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfibp1Q8C8U0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfibp1Q8C8U0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfibp1Q8C8U0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfibp1Q8C8U0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ppfibp1Q8C8U0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppfibp1Q8C8U0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms