Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc30Q8BVF4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc30Q8BVF4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc30Q8BVF4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc30Q8BVF4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc30Q8BVF4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc30Q8BVF4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc30Q8BVF4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc30Q8BVF4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc30Q8BVF4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc30Q8BVF4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc30Q8BVF4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc30Q8BVF4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc30Q8BVF4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc30Q8BVF4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc30Q8BVF4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc30Q8BVF4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms