Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nop53Q8BK35 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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