Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ecm29Q6PDI5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ecm29Q6PDI5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ecm29Q6PDI5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ecm29Q6PDI5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ecm29Q6PDI5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ecm29Q6PDI5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ecm29Q6PDI5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ecm29Q6PDI5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ecm29Q6PDI5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ecm29Q6PDI5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ecm29Q6PDI5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ecm29Q6PDI5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ecm29Q6PDI5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ecm29Q6PDI5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ecm29Q6PDI5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ecm29Q6PDI5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ecm29Q6PDI5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ecm29Q6PDI5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ecm29Q6PDI5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ecm29Q6PDI5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ecm29Q6PDI5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ecm29Q6PDI5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ecm29Q6PDI5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ecm29Q6PDI5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ecm29Q6PDI5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ecm29Q6PDI5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ecm29Q6PDI5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ecm29Q6PDI5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ecm29Q6PDI5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ecm29Q6PDI5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ecm29Q6PDI5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms