Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zbtb40Q6PCS8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zbtb40Q6PCS8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zbtb40Q6PCS8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zbtb40Q6PCS8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zbtb40Q6PCS8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zbtb40Q6PCS8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zbtb40Q6PCS8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zbtb40Q6PCS8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zbtb40Q6PCS8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zbtb40Q6PCS8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zbtb40Q6PCS8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
Zbtb40Q6PCS8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zbtb40Q6PCS8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zbtb40Q6PCS8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zbtb40Q6PCS8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zbtb40Q6PCS8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zbtb40Q6PCS8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zbtb40Q6PCS8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zbtb40Q6PCS8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zbtb40Q6PCS8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zbtb40Q6PCS8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zbtb40Q6PCS8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zbtb40Q6PCS8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zbtb40Q6PCS8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zbtb40Q6PCS8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zbtb40Q6PCS8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zbtb40Q6PCS8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Zbtb40Q6PCS8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zbtb40Q6PCS8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zbtb40Q6PCS8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zbtb40Q6PCS8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zbtb40Q6PCS8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zbtb40Q6PCS8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zbtb40Q6PCS8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zbtb40Q6PCS8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zbtb40Q6PCS8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zbtb40Q6PCS8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zbtb40Q6PCS8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zbtb40Q6PCS8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zbtb40Q6PCS8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zbtb40Q6PCS8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zbtb40Q6PCS8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zbtb40Q6PCS8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zbtb40Q6PCS8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Zbtb40Q6PCS8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zbtb40Q6PCS8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zbtb40Q6PCS8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zbtb40Q6PCS8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zbtb40Q6PCS8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zbtb40Q6PCS8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zbtb40Q6PCS8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Zbtb40Q6PCS8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
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