Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS82

Retreg2, Reticulophagy regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Retreg2Q6NS82 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms