Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Capn11Q6J756 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms