Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC6

Tro, Tro protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TroQ6DIC6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TroQ6DIC6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms