Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Knl1Q66JQ7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Knl1Q66JQ7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Knl1Q66JQ7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Knl1Q66JQ7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Knl1Q66JQ7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Knl1Q66JQ7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Knl1Q66JQ7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Knl1Q66JQ7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Knl1Q66JQ7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Knl1Q66JQ7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Knl1Q66JQ7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Knl1Q66JQ7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Knl1Q66JQ7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Knl1Q66JQ7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Knl1Q66JQ7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Knl1Q66JQ7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Knl1Q66JQ7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Knl1Q66JQ7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Knl1Q66JQ7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Knl1Q66JQ7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Knl1Q66JQ7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Knl1Q66JQ7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Knl1Q66JQ7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Knl1Q66JQ7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Knl1Q66JQ7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Knl1Q66JQ7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Knl1Q66JQ7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Knl1Q66JQ7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Knl1Q66JQ7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Knl1Q66JQ7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Knl1Q66JQ7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Knl1Q66JQ7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Knl1Q66JQ7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Knl1Q66JQ7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Knl1Q66JQ7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Knl1Q66JQ7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Knl1Q66JQ7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Knl1Q66JQ7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Knl1Q66JQ7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Knl1Q66JQ7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Knl1Q66JQ7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Knl1Q66JQ7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Knl1Q66JQ7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
Knl1Q66JQ7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Knl1Q66JQ7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Knl1Q66JQ7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Knl1Q66JQ7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Knl1Q66JQ7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Knl1Q66JQ7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Knl1Q66JQ7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Knl1Q66JQ7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Knl1Q66JQ7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Knl1Q66JQ7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Knl1Q66JQ7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Knl1Q66JQ7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Knl1Q66JQ7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Knl1Q66JQ7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Knl1Q66JQ7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Knl1Q66JQ7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Knl1Q66JQ7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Knl1Q66JQ7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Knl1Q66JQ7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Knl1Q66JQ7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Knl1Q66JQ7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Knl1Q66JQ7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Knl1Q66JQ7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Knl1Q66JQ7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Knl1Q66JQ7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Knl1Q66JQ7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Knl1Q66JQ7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Knl1Q66JQ7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Knl1Q66JQ7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Knl1Q66JQ7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Knl1Q66JQ7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Knl1Q66JQ7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Knl1Q66JQ7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Knl1Q66JQ7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Knl1Q66JQ7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Knl1Q66JQ7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Knl1Q66JQ7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Knl1Q66JQ7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Knl1Q66JQ7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Knl1Q66JQ7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Knl1Q66JQ7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Knl1Q66JQ7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Knl1Q66JQ7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Knl1Q66JQ7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Knl1Q66JQ7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Knl1Q66JQ7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Knl1Q66JQ7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Knl1Q66JQ7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Knl1Q66JQ7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Knl1Q66JQ7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Knl1Q66JQ7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Knl1Q66JQ7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Knl1Q66JQ7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Knl1Q66JQ7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Knl1Q66JQ7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Knl1Q66JQ7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.8 ms