Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim25Q61510 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim25Q61510 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim25Q61510 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim25Q61510 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim25Q61510 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim25Q61510 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim25Q61510 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim25Q61510 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim25Q61510 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim25Q61510 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim25Q61510 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim25Q61510 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim25Q61510 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim25Q61510 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim25Q61510 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim25Q61510 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim25Q61510 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim25Q61510 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim25Q61510 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim25Q61510 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim25Q61510 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim25Q61510 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim25Q61510 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim25Q61510 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim25Q61510 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim25Q61510 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim25Q61510 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim25Q61510 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim25Q61510 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim25Q61510 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim25Q61510 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim25Q61510 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim25Q61510 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim25Q61510 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trim25Q61510 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim25Q61510 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim25Q61510 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim25Q61510 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim25Q61510 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim25Q61510 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim25Q61510 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim25Q61510 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim25Q61510 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim25Q61510 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim25Q61510 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim25Q61510 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim25Q61510 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim25Q61510 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim25Q61510 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim25Q61510 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim25Q61510 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim25Q61510 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim25Q61510 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim25Q61510 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim25Q61510 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim25Q61510 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms