Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mre11Q61216 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mre11Q61216 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mre11Q61216 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mre11Q61216 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mre11Q61216 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mre11Q61216 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mre11Q61216 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mre11Q61216 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mre11Q61216 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mre11Q61216 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mre11Q61216 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mre11Q61216 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mre11Q61216 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mre11Q61216 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mre11Q61216 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mre11Q61216 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mre11Q61216 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mre11Q61216 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mre11Q61216 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mre11Q61216 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mre11Q61216 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mre11Q61216 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mre11Q61216 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mre11Q61216 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mre11Q61216 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mre11Q61216 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mre11Q61216 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mre11Q61216 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mre11Q61216 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mre11Q61216 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mre11Q61216 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mre11Q61216 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mre11Q61216 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mre11Q61216 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mre11Q61216 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mre11Q61216 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mre11Q61216 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mre11Q61216 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mre11Q61216 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mre11Q61216 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mre11Q61216 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mre11Q61216 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Mre11Q61216 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms