Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms