Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SynrgQ5SV85 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SynrgQ5SV85 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SynrgQ5SV85 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SynrgQ5SV85 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SynrgQ5SV85 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SynrgQ5SV85 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SynrgQ5SV85 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SynrgQ5SV85 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SynrgQ5SV85 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SynrgQ5SV85 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SynrgQ5SV85 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SynrgQ5SV85 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SynrgQ5SV85 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SynrgQ5SV85 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SynrgQ5SV85 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SynrgQ5SV85 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SynrgQ5SV85 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SynrgQ5SV85 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SynrgQ5SV85 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SynrgQ5SV85 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SynrgQ5SV85 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SynrgQ5SV85 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SynrgQ5SV85 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SynrgQ5SV85 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SynrgQ5SV85 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SynrgQ5SV85 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SynrgQ5SV85 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SynrgQ5SV85 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SynrgQ5SV85 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SynrgQ5SV85 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SynrgQ5SV85 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SynrgQ5SV85 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SynrgQ5SV85 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SynrgQ5SV85 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms