Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim58Q5NCC9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.5 ms