Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY23

Fdxacb1, Ferredoxin-fold anticodon-binding domain-containing protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdxacb1Q3UY23 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fdxacb1Q3UY23 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fdxacb1Q3UY23 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms