Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ7

Prdm10, PR domain zinc finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm10Q3UTQ7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prdm10Q3UTQ7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.5 ms