Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms