Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1N2

Srebf2, Sterol regulatory element-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srebf2Q3U1N2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srebf2Q3U1N2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms