Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rufy4Q3TYX8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms