Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NeblQ0II04 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms