Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmklr1P97468 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms