Protein–RNA interactions for Protein: P62962

Pfn1, Profilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn1P62962 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfn1P62962 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.1 ms