Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Smg6P61406 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Smg6P61406 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Smg6P61406 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Smg6P61406 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Smg6P61406 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Smg6P61406 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Smg6P61406 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smg6P61406 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smg6P61406 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smg6P61406 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smg6P61406 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Smg6P61406 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Smg6P61406 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Smg6P61406 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Smg6P61406 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Smg6P61406 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smg6P61406 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smg6P61406 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smg6P61406 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smg6P61406 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smg6P61406 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smg6P61406 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smg6P61406 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smg6P61406 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smg6P61406 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smg6P61406 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smg6P61406 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Smg6P61406 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Smg6P61406 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Smg6P61406 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Smg6P61406 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smg6P61406 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smg6P61406 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smg6P61406 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Smg6P61406 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smg6P61406 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Smg6P61406 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smg6P61406 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smg6P61406 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smg6P61406 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smg6P61406 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smg6P61406 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smg6P61406 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Smg6P61406 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Smg6P61406 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms