Protein–RNA interactions for Protein: P59997

Kdm2a, Lysine-specific demethylase 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2aP59997 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kdm2aP59997 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms