Protein–RNA interactions for Protein: P54775

Psmc4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc4P54775 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Psmc4P54775 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmc4P54775 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms