Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fgd1P52734 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fgd1P52734 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms