Protein–RNA interactions for Protein: P52651

Rhox5, Homeobox protein Rhox5, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox5P52651 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhox5P52651 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rhox5P52651 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rhox5P52651 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhox5P52651 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhox5P52651 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms