Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa11P50709 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa11P50709 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa11P50709 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa11P50709 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Defa11P50709 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa11P50709 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa11P50709 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms