Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psen1P49769 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psen1P49769 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psen1P49769 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psen1P49769 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psen1P49769 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psen1P49769 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psen1P49769 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psen1P49769 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psen1P49769 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psen1P49769 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psen1P49769 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Psen1P49769 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms