Protein–RNA interactions for Protein: P37172

Acvr1, Activin receptor type-1, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1P37172 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Acvr1P37172 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Acvr1P37172 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Acvr1P37172 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Acvr1P37172 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Acvr1P37172 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Acvr1P37172 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Acvr1P37172 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Acvr1P37172 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Acvr1P37172 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Acvr1P37172 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Acvr1P37172 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Acvr1P37172 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Acvr1P37172 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Acvr1P37172 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.7 ms