Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxa10P31310 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms