Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cnga1P29974 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cnga1P29974 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cnga1P29974 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cnga1P29974 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cnga1P29974 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cnga1P29974 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cnga1P29974 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cnga1P29974 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cnga1P29974 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cnga1P29974 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cnga1P29974 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cnga1P29974 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cnga1P29974 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cnga1P29974 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cnga1P29974 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cnga1P29974 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cnga1P29974 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cnga1P29974 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cnga1P29974 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cnga1P29974 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cnga1P29974 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cnga1P29974 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cnga1P29974 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cnga1P29974 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cnga1P29974 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cnga1P29974 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cnga1P29974 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cnga1P29974 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cnga1P29974 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cnga1P29974 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cnga1P29974 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cnga1P29974 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cnga1P29974 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cnga1P29974 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cnga1P29974 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cnga1P29974 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 216.1 ms