Protein–RNA interactions for Protein: P19788

Mgp, Matrix Gla protein, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MgpP19788 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MgpP19788 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MgpP19788 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MgpP19788 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MgpP19788 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MgpP19788 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MgpP19788 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MgpP19788 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MgpP19788 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MgpP19788 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MgpP19788 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MgpP19788 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MgpP19788 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MgpP19788 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MgpP19788 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MgpP19788 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MgpP19788 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MgpP19788 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MgpP19788 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MgpP19788 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MgpP19788 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MgpP19788 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MgpP19788 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MgpP19788 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MgpP19788 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MgpP19788 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MgpP19788 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MgpP19788 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MgpP19788 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MgpP19788 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MgpP19788 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MgpP19788 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MgpP19788 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MgpP19788 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MgpP19788 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MgpP19788 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MgpP19788 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MgpP19788 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MgpP19788 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MgpP19788 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MgpP19788 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MgpP19788 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MgpP19788 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MgpP19788 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MgpP19788 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MgpP19788 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MgpP19788 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MgpP19788 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MgpP19788 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MgpP19788 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MgpP19788 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MgpP19788 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MgpP19788 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MgpP19788 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MgpP19788 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MgpP19788 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MgpP19788 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MgpP19788 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MgpP19788 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MgpP19788 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MgpP19788 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MgpP19788 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MgpP19788 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MgpP19788 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MgpP19788 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MgpP19788 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MgpP19788 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MgpP19788 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MgpP19788 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MgpP19788 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MgpP19788 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MgpP19788 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MgpP19788 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MgpP19788 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MgpP19788 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MgpP19788 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MgpP19788 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MgpP19788 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MgpP19788 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MgpP19788 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MgpP19788 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
MgpP19788 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MgpP19788 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MgpP19788 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MgpP19788 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MgpP19788 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MgpP19788 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MgpP19788 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MgpP19788 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MgpP19788 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MgpP19788 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MgpP19788 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MgpP19788 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MgpP19788 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MgpP19788 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MgpP19788 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MgpP19788 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MgpP19788 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MgpP19788 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MgpP19788 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms