Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NelfeP19426 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
NelfeP19426 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NelfeP19426 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NelfeP19426 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NelfeP19426 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NelfeP19426 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NelfeP19426 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NelfeP19426 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NelfeP19426 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NelfeP19426 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NelfeP19426 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NelfeP19426 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NelfeP19426 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NelfeP19426 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NelfeP19426 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NelfeP19426 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NelfeP19426 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NelfeP19426 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
NelfeP19426 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NelfeP19426 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NelfeP19426 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
NelfeP19426 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NelfeP19426 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NelfeP19426 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NelfeP19426 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NelfeP19426 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NelfeP19426 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NelfeP19426 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
NelfeP19426 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NelfeP19426 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NelfeP19426 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NelfeP19426 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NelfeP19426 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NelfeP19426 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NelfeP19426 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NelfeP19426 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NelfeP19426 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NelfeP19426 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NelfeP19426 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NelfeP19426 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NelfeP19426 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NelfeP19426 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NelfeP19426 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NelfeP19426 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NelfeP19426 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NelfeP19426 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NelfeP19426 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NelfeP19426 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NelfeP19426 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms