Protein–RNA interactions for Protein: P16125

Ldhb, L-lactate dehydrogenase B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LdhbP16125 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LdhbP16125 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LdhbP16125 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LdhbP16125 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LdhbP16125 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LdhbP16125 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LdhbP16125 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LdhbP16125 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LdhbP16125 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LdhbP16125 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LdhbP16125 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LdhbP16125 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LdhbP16125 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LdhbP16125 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LdhbP16125 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LdhbP16125 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LdhbP16125 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LdhbP16125 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LdhbP16125 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LdhbP16125 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LdhbP16125 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LdhbP16125 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LdhbP16125 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LdhbP16125 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LdhbP16125 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LdhbP16125 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LdhbP16125 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LdhbP16125 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LdhbP16125 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LdhbP16125 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LdhbP16125 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LdhbP16125 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LdhbP16125 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LdhbP16125 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LdhbP16125 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LdhbP16125 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LdhbP16125 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LdhbP16125 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LdhbP16125 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LdhbP16125 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LdhbP16125 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LdhbP16125 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LdhbP16125 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LdhbP16125 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LdhbP16125 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LdhbP16125 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LdhbP16125 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LdhbP16125 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LdhbP16125 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LdhbP16125 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LdhbP16125 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LdhbP16125 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LdhbP16125 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LdhbP16125 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LdhbP16125 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LdhbP16125 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms